Σύμφωνα με τον αρχικό σχεδιασμό της διοργανώτριας αρχής, το νέο πρωτάθλημα της SL2 θα διεξαχθεί σε δύο ομίλους (βόρειος, νότιος) σύμφωνα με γεωγραφικά κριτήρια και πρόκειται να συμμετέχουν 36 ομάδες συνολικά:
ΑΕΛ
Ξάνθη
Λεβαδειακός
Εργοτέλης
Χανιά
Διαγόρας Ρόδου
Παναχαϊκή
Τρίκαλα
Απόλλων Λάρισας
Δόξα Δράμας
Καραϊσκάκης
ΟΦ Ιεράπετρας
Βέροια
Καβάλα
Πανσερραϊκός
Ολυμπιακός Βόλου
Πιερικός
Θεσπρωτός
Τρίγλια (Ηρακλής)
Αλμωπός Αριδαίας
Καλαμάτα
Ρόδος
Επισκοπή
Ιάλυσος
Σαντορίνη
Καλλιθέα
Αιγάλεω
Νίκη Βόλου
Αναγέννηση Καρδίτσας
Κηφισιά
Ηρόδοτος
Ορφέας Ξάνθης
Ολυμπιακός Β
ΠΑΟΚ Β
ΑΕΚ Β
Παναθηναϊκός Β
Σε περίπτωση που κάποια ομάδα δεν μπορέσει να ανταποκριθεί και δεν δηλώσει συμμετοχή, αποφασίστηκε να καλυφθεί το κενό, είτε από ομάδα της Football League που υποβιβάστηκε είτε από ομάδα που συμμετείχε στα μπαράζ της Γ’ Εθνικής και δεν ανέβηκε. Αρκεί βέβαια, να καλύπτει τα απαραίτητα οικονομικά κριτήρια (μετοχικό κεφάλαιο 350.000 ευρώ και εγγυητική 150.000 ευρώ).
